今天给各位分享分子动力学模拟的知识，其中也会对进行解释，如果能碰巧解决你现在面临的问题，别忘了关注本站，现在开始吧！
可以。分子动力学模拟可以建织物的模型， 选取所要研究的系统并建立适当的模拟模型。设定模拟区域的边界条件，选取粒子间作用势模型。分子动力学是一套分子模拟方法，该方法主要是依靠 计算机来模拟分子、原子体系的运动，是一种多体模拟方法。
分子动力学模拟是从经典力学出发,把系统看成为微观粒子的集合,通过研究微观状态下的粒子在不同系综的运动方程,计算体系的构型积分,并以构型积分的结果为基础进一步计算体系的热力学量,从而得到体系的宏观特征和基本运动规律.
由于分子动力学模拟是基于原子间相互作用势,因此它运用非常灵活,可以应用在多种不同体系中.
分子动力学模拟普遍采用的相互作用势为二体对势：Buckingham 势和 Lennard-Jones势
根据模拟大小普遍在一天。
分子动力学方法模拟基本步骤第一步：即模型的设定，也就是势函数的选取。势函数的研究和物理系统上对物质的描述研究息息相关。最早是硬球势，即小于临界值时无穷大，大于等于临界值时为零。常用的是LJ势函数，还有EAM势函数，不同的物质状态描述用不同的势函数。第二步：给定初始条件。运动方程的求解需要知道粒子的初始位置和速度，不同的算法要求不同的初始条件。如：verlet算法需要两组坐标来启动计算，一组零时刻的坐标，一组是前进一个时间步的坐标或者一组零时刻的速度值。第三步：趋于平衡计算。在边界条件和初始条件给定后就可以解运动方程，进行分子动力学模拟。但这样计算出的系统是不会具有所要求的系统的能量，并且这个状态本身也还不是一个平衡态。第四步：宏观物理量的计算。实际计算宏观的物理量往往是在模拟的最后揭短进行的。它是沿相空间轨迹求平均来计算得到的（时间平均代替系综平均）
分子动力学可以用于NPT,NVE,NVT等系综的计算,是一种基于牛顿力学确定论的热力学计算方法,可以广泛应用于物理,化学,生物,材料,医学等各个领域.
目前由于计算机性能的限制,其可计算的尺寸还很小,一般计算的粒子数会不会超过5位数,计算的尺寸一般只有几十纳米甚至更小
确定起始构型
进行分子动力学模拟的第一步是确定起始构型,一个能量较低的起始构型是进行分子模拟的基础 ,一般分子的起始构型主要来自实验数据或量子化学计算.在确定起始构型之后要赋予构成分子的各个原子速度,这一速度是根据玻尔兹曼分布随机生成的,由于速度的分布符合玻尔兹曼统计,因此在这个阶段,体系的温度是恒定的.另外,在随机生成各个原子的运动速度之后须进行调整,使得体系总体在各个方向上的动量之和为零,即保证体系没有平动位移.
进入平衡相
由上一步确定的分子组建平衡相,在构建平衡相的时候会对构型、温度等参数加以监控.
进入生产相
进入生产相之后体系中的分子和分子中的原子开始根据初始速度运动,可以想象其间会发生吸引、排斥乃至碰撞,这时就根据牛顿力学和预先给定的粒子间相互作用势来对各个粒子的运动轨迹进行计算,在这个过程中,体系总能量不变,但分子内部势能和动能不断相互转化,从而体系的温度也不断变化,在整个过程中,体系会遍历势能面上的各个点（理论上,如果模拟时间无限）.计算分析所用样本正是从这个过程中抽取的.
计算结果用抽样所得体系的各个状态计算当时体系的势能,进而计算构型积分.
鉴于既然题主都来提问了，那应该是不太想继续科研了，想看看其他出路。而且就算想继续走这条路，身边的人也能给出建议。所以说分子动力学模拟就业的前景也是很不错的，下面将会着手于几项工作。
其他的路嘛，就身边的情况看，互联网，金融，各种其他企业事业单位都有。
互联网的话，题主是C++，很好，码农鄙视链较高的位置。C++用途很广泛，这是一个优势。对于题主来说，劣势可能就是第一不是科班，项目经验不足，年龄较大。所以，你可以去看看互联网企业招聘要求硕士以上的是哪些岗位。不过一般都是算法工程师，计算机视觉及图形学，数据分析，机器学习，大数据等。
金融行业，这个题主应该来不及了。一般要CPA，CFA，实习经历。一年时间肯定不够。而且金融系都招不过来。
公务员，这个感觉来得及，不过题主应该不太喜欢。
企业事业单位，比如一线好的高中（别的高中就不要去了，待遇不行，你肯定不能接受），还有就是企业的研发机构，很多答主说的药企什么的。还有就是现在有很多做计算模拟软件或者培训的企业，待遇也还不错。
基本上我知道的这个领域也就这么几条路。当然，我没有把继承家族企业的同学算在内。
分子动力学模拟的介绍就聊到这里吧，感谢你花时间阅读本站内容，更多关于、分子动力学模拟的信息别忘了在本站进行查找喔。
版权声明：本站所有资料均为网友推荐收集整理而来,仅供学习和研究交流使用。
工作时间：8:00-18:00
客服电话
电子邮件
扫码二维码
获取最新动态
